Ponaučení z celoexomového sekvenování rodin s diabetem MODY

Lessons from whole-exome sequencing in MODYX families

Dusatkova, P; Fang, MY; Pruhova, S; Gjesing, AP; Cinek, O; Hansen, T; Pedersen, OB; Xu, X; Lebl, J. Diabetes Research and Clinical Practice. 2014 Jun;104(3):e72–4. doi: 10.1016/j.diabres.2014.03.008. Epub 2014 Mar 19. IF: 2.536

RNDr. Petra Dušátková, Ph.D.

Publikaci představuje první autorka RNDr. Petra Dušátková, Ph.D., z Pediatrické kliniky 2. LF UK a FN Motol.

Diabetes typu MODY je dědičné onemocnění způsobené poruchou v jediném genu. Typický je výskyt zvýšené hladiny cukru v několika po sobě jdoucích generacích v rodině a věk v době diagnózy zpravidla do 25 let. Dosud bylo popsáno více než deset různých genů, jejichž změny jsou za tento typ diabetu zodpovědné. Stále však existuje velké množství rodin, u nichž nebyla genetická příčina jejich diabetu objasněna, ačkoli klinicky odpovídají diabetu MODY a označují se tudíž MODYX.

V posledních letech se stává dostupnější metoda celoexomového sekvenování, která umožní přečíst sekvenci všech protein-kódujících úseků lidského genomu najednou. Proto jsme touto metodou vyšetřili DNA šesti českých MODYX rodin.

Zatímco u čtyř rodin stále probíhá zpracování dat a zejména navazující konfirmační studie, výsledky u zbývajících dvou rodin nás poučily o nutnosti neustálé kontroly technických parametrů rutinního molekulárně-genetického vyšetřování i klinických kritérií pro diagnostiku jednotlivých podtypů MODY. U rodiny CZ01 celoexomové sekvenování odhalilo mutaci ve známém MODY genu HNF1A, která námi nebyla detekována klasickou metodou přímé sekvenace. Důvodem byla přítomnost polymorfismu (nepatogenní záměny jednoho nukleotidu) v sekvenci primeru. Tento polymorfismus nebyl v době navrhování primeru v databázích popsán. U rodiny CZ02 jsme pomocí celoexomového sekvenování odhalili kauzální mutaci v genu HNF1B. Dosud bylo s mutacemi v tomto genu spojováno poškození urogenitálního traktu, které převažuje nad výskytem diabetu. V rodině CZ02 bylo však popsáno jen onemocnění diabetem.

Výsledky jsme okamžitě aplikovali do naší rutinní praxe v rámci vyšetřování pacientů suspektních na MODY diabetes: zkontrolovali jsme a případně upravili všechny sekvence primerů a gen HNF1B vyšetřujeme nyní u všech MODYX rodin bez ohledu na přítomnost poškození urogenitálního traktu.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24698406

Vytvořeno: 28. 12. 2015 / Upraveno: 1. 2. 2019 / Mgr. Ing. Tereza Kůstková