V roce 2014 byl v Dětském kardiocentru zahájen program transplantace srdce u dětí. Do konce roku 2022 bylo provedeno 30 transplantací u 29 pacientů. Vrozená srdeční vada byla přítomna u 15 pacientů (jednokomorová cirkulace 10/15) a kardiomyopatie u 14 pacientů. Deset pacientů mělo jako přemostění k transplantaci dlouhodobou mechanickou podporu oběhu po dobu průměrně 104 dnů. V roce 2021 byl poprvé k přeshraničnímu transportu srdce pro dětského příjemce použit transportní systém bijícího dárcovského srdce Transmedics. Jeden pacient zemřel časně a jeden v dlouhodobém průběhu. Pravděpodobnost přežití je v současné době 93 procent v pěti letech po transplantaci (viz graf). Tyto výsledky jsou shodné s nejlepšími centry na světě a dokládají možnost etablovat úspěšný komplexní program transplantace srdce v malé zemi s dobře rozvinutou pediatrickou kardiovaskulární péčí.