Profiling of polychromatic flow cytometry data on B-cells reveals patients' clusters in common variable immunodeficiency.

Kalina T, Stuchlý J, Janda A, Hrusák O, Růzicková S, Sedivá A, Litzman J, Vlková M. Cytometry A. 2009 Nov;75(11):902–9. IF: 3.259

V časopise Cytometry vychází práce, na které spolupracovalo několik předních českých pracovišť, které pečují o pacienty s CVID, heterogenní klinickou jednotkou, která je charakterizována sníženou schopností B lymfocytů produkovat protilátky.
Hlavní autor práce MUDr. Tomáš Kalina, Ph.D., z Kliniky dětské hematologie a Onkologie shrnuje nejvýznamější poznatky této studie: Spoluprací klinických pracovišť s tradicí péče o imunodeficitní pacienty a navazující výzkum (Oddělení imunologie FN U sv. Anny v Brně, Ústavu imunologie naší fakulty) s laboratoří CLIP-Cytometrie, Kliniky dětské hematolgoie a onkologie, která se dlouhodobě zabývá analýzou krevních buněk u leukémií i v průběhu normálního vývoje krvetvorby, jsme vytvořili unikátní tým, kterému se podařilo najít zcela nový způsob jak porovnávat složení B-buněk u pacientů s CVID. Tento syndrom je heterogení a jeho heterogenita ztěžuje identifikaci konkrétní poruchy u pacientů na úrovni molekulárních dějů. Metoda profilování B-buněčného zastoupení (sledujeme jaké vývojové podtypy buněk v periferní krvi pacientů chybějí a které naopak přebývají) nám umožňuje vytvořit skupiny pacientů, které mají složení B-buněk podobné a je u nich možné předpokládat, že i molekulární blok bude ve stejné dráze. Detailnější práce na rozsáhlejší skupině pacientů stále probíhá.
 
Co zaujalo na této práci vás jako autora?
Ve zcela obecné rovině mne zaujal především fakt, že jsme došli k řešení, které nebylo v původním plánu projektu vůbec zmíněno. Shodou šťastných náhod jsme do našeho týmu přizvali matematika se zájmem o biologii a právě na rozhraní matematiky a cytometrie se nám podařilo najít zcela unikátní řešení. Přitom ani já jako cytometrista, ani on jako matematik bychom to sami nedokázali ani naplánovat ani provést. Celkově je tento projekt důkazem přínosu propojování pracovišť a přístupů pro řešení výzkumných otázek.

Vytvořeno: 16. 12. 2009 / Upraveno: 4. 1. 2019 / prof. MUDr. Radek Špíšek, Ph.D.